FoQUal a été créé à l'initiative des représentants "qualité" des Hôpitaux universitaires de Genève (HUG), de l'Ente ospedaliero cantonale (EOC) du Tessin, des Hospices cantonaux vaudois (HC) et de son Institut universitaire de médecine sociale et préventive (IUMSP), du Résau santé Valais (RSV) et de l'association Vaud-Genève.
FoQual est ouvert à d'autres établissements hospitaliers, ainsi qu'aux représentants des services de santé publique en charge des questions liées à la qualité.
composition